References

1. 1. Рубан Г.И. Адаптивные эколого-морфологические особенности сибирского осетра (Acipenser baerii Brandt) // Биология внутренних вод. 2019. № 2–1. С. 71–78. https://doi.org/10.1134/S032096521902013X
2. 2. Malyutin V.S. On the history of fish husbandry of Siberian sturgeon Acipenser baerii from the Lena river for acclimatization and commercial cultivation // J. Ichthyology. 2009. V. 49. № 5. P. 376–382. https://doi.org/10.1134/S0032945209050038
3. 3. Рубан Г.И. Сибирский осетр Acipenser baerii Brandt: структура вида и экология // Ин-т проблем экол. и эвол. им. А.Н. Северцова РАН. М.: Изд-во ГЕОС, 1999. 236 с.
4. 4. Электронный ресурс: http://aquacultura.org/science/genetic-research/
5. 5. Greaves L.C., Reeve A.K., Taylor et al. Mitochondrial DNA and disease // Journal of Pathology. 2012. V. 226. № 2. P. 274–286. https://doi.org/10.1002/path.3028
6. 6. Moritz C., Dowling T.E., Brown W.M. Evolution of ani-mal mitochondrial DNA: Relevance for population biology and systematic // Annual Rev. Ecol., Evol., and Systematics. 1987. V. 18. P. 269–292.
7. 7. Liu J., Tan C., Xiao K. et al. The complete mitochondrial genome of Dabry's sturgeon (Acipenser dabryanus) // Mitochondrial DNA B Resour. 2017. V. 2. № 1. P. 54–55. https://doi.org/10.1080/23802359.2017.1280698
8. 8. Nedoluzhko A.V., Sharko F.S., Tsygankova S.V. et al. Molecular phylogeny of one extinct and two critically endangered Central Asian sturgeon species (genus Pseudoscaphirhynchus) based on their mitochondrial genomes // Scientific Report. 2020. V. 10. № 722. https://doi.org/10.1038/s41598-020-57581-y
9. 9. Ludwig А., Belfiore N.M., Pitrа C. et al. Genome duplicаtion events аnd functionаl reduction of ploidy levels in sturgeon (Аcipenser, Huso аnd Scаphirhynchus) // Genetics. 2001. V. 158. P. 1203–1215.
10. 10. Мюге Н.С., Барминцева А.Е., Расторгуев С.М. и др. Полиморфизм контрольной области митохондриальной ДНК у восьми видов осетровых и разработка системы идентификации видов на основе ДНК // Генетика. 2008. Т. 44. С. 913–919. https://doi.org/10.1134/S1022795408070065
11. 11. Jenneckens I., Meyer J.N., Debus L. et al. Evidence of mitochondrial DNA clones of Siberian sturgeon, Acipenser baerii, within Russian sturgeon, Acipenser gueldenstaedtii, caught in the River Volga // Ecology Letters. 2000. V. 3. P. 503–508. https://doi.org/10.1046/j.1461-0248.2000.00179.x
12. 12. Dadkhah K., Mianji G.R., Barzegar A. et al. Characterization of the mitochondrial Huso huso genome and new aspects of its organization in the presence of tandem repeats in 12S rRNA // BMC Ecology and Evolution. 2023. V. 23. № 55. https://doi.org/10.1186/s12862-023-02166-2
13. 13. Hu Q., Pan Y., Xia H. et al. Species Identification of Caviar Based on Multiple DNA Barcoding // Molecules. 2023. V. 28. № 13. https://doi.org/10.3390/molecules28135046
14. 14. Chen X.W., Jiang S., Shi Z.Y. et al. Mitochondrial genome of the Siberian sturgeon Acipenser baerii // Mitochondrial DNA. 2012. V. 23. № 2. P. 120–122. https://doi.org/10.3109/19401736.2011.653804
15. 15. Andrews S. FastQC: A quality control tool for high throughput sequence data. 2010. Available online t: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc
16. 16. Ewels P., Magnusson M., Lundin S. et al. MultiQC: Summarize analysis results for multiple tools and samples in a single report // Bioinformatics. 2016. V. 32. № 19. P. 3047–3048. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw354
17. 17. Li H. Aligning sequence reads, clone sequences and assembly contigs with BWA-MEM // Genomics. 2013. https://doi.org/10.48550/arXiv.1303.3997
18. 18. Danecek P., Bonfield J.K., Liddle J. et al. Twelve years of SAMtools and BCFtools // GigaScience. 2021. V. 10. № 12. https://doi.org/10.1093/gigascience/giab008
19. 19. Li H. A statistical framework for SNP calling, mutation discovery, association mapping and population genetical parameter estimation from sequencing data // Bioinformatics. 2011. V. 27. № 21. P. 2987–2993.
20. 20. Li H. Tabix: Fast retrieval of sequence features from generic TAB-delimited files // Bioinformatics. 2011. V. 27. P. 718–719. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq671
21. 21. Thorvaldsdottir H., Robinson J., Mesirov J. Integrative genomics viewer (Igv): High-performance genomics data visualization and exploration // Briefings in Bioinformatics. 2012. V. 14. № 3. P. 178–192. https://doi.org/10.1093/bib/bbs017
22. 22. Барминцева А.Е., Мюге Н.С. Генетический полиморфизм сибирского осетра Acipenser baerii Brandt, 1869 в аквакультуре // Генетика. 2018. Т. 54. № 2. С. 216–223.
23. 23. Барминцева А.Е., Мюге Н.С. Природный генетический полиморфизм и филогеография сибирского осетра Acipenser baerii Brandt, 1869 // Генетика. 2017. Т. 53. № 3. С. 345–355.
24. 24. Ludwig A., May B., Debus L. et al. Heteroplasmy in the mtDNA control region of sturgeon (Acipenser, Huso and Scaphirhynchus) // Genetics. 2000. V. 156. № 4. P. 1933–1947. https://doi.org/10.1093/genetics/156.4.1933
25. 25. Водолажский Д.И. Гипервариабельность региона D-петли митохондриальной ДНК русского осетра Acipenser gueldenstaedtii (Acipenseriformes, Acipenseridae) // Вопросы ихтиологии. 2008. Т. 48. № 2. С. 266–275.
26. 26. Корниенко И.В., Чеботарев Д.А., Махоткин М.А. и др. Терминация репликации и механизмы гетероплазмии митохондриальных ДНК у осетровых рыб // Молекулярная биология. 2019. Т. 53. № 1. С. 53–63. https://doi.org/10.1134/S0026898419010063