Везде

ОБНГенетика Russian Journal of Genetics

  • ISSN (Print) 0016-6758
  • ISSN (Online) 3034-5103

Оценка генетического полиморфизма популяции Quercus robur L. в старовозрастной дубраве Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина РАН по данным ISSR-анализа

Вы можете
Код статьи
S30345103S0016675825050037-1
DOI
10.7868/S3034510325050037
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Гревцова В. В.
  • Аффилиация: Главный ботанический сад им. Н.В. Цицина Российской академии наук
Галкина М. А.
  • Аффилиация: Главный ботанический сад им. Н.В. Цицина Российской академии наук
Шанцер И. А.
  • Аффилиация: Главный ботанический сад им. Н.В. Цицина Российской академии наук
Том/ Выпуск
Том 61 / Номер выпуска 5
Страницы
30-40
Аннотация
Дубрава Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина известна с 1731 г. С 1743 по 1917 г. это были владения графов Шереметевых. Отдельные сведения из литературных источников позволяют предположить искусственное происхождение части дубовых насаждений. Цель данного исследования – оценка генетического разнообразия Q. robur в дубравной экосистеме на территории ГБС РАН и установление генетических взаимосвязей с деревьями дуба из центральных областей европейской части России. Для характеристики полиморфизма выборок Q. robur использован метод ISSR-анализа. Анализ генетических взаимосвязей с помощью кластеризации методами UPGMA и главных координат (PCoA) позволил выявить генетическую обособленность образцов из Владимирской и Рязанской областей относительно образцов из ГБС РАН, г. Воронежа, Московской, Тверской, Тульской и Липецкой областей. Показатели генетического полиморфизма в сформировавшейся популяции в дубравной экосистеме на территории ГБС РАН имеют следующие значения: эффективное число аллелей (Ne) 1.480 ± 0.042; индекс генетического разнообразия (I) 0.455 ± 0.024; ожидаемая гетерозиготность (He) 0.294 ± 0.020. Указанные параметры можно считать отправной точкой при генетическом мониторинге популяции.
Ключевые слова
Quercus robur популяция московские дубравы генетическое разнообразие генетический мониторинг
Дата публикации
01.05.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
99

Библиография

  1. 1. Petit R.J., Hampe A. Some evolutionary consequences of being a tree // Ann. Review Ecol. Evol. and Systematics. 2006. V. 37. P. 187–214.
  2. 2. Скворцов А.К., Виноградова Ю.К., Куклина А.Г. и др. Формирование устойчивых интродукционных популяций: абрикос, черешня, черемуха, смородина, арония / Под. ред. Демидова А.С. М.: Наука, 2005. 187 с.
  3. 3. Семерикова С.А., Филлипов Е.Г., Семериков Н.В., Исаков И.Ю. Филогеография европейских широколиственных видов деревьев в Восточной части ареала // Экология и эволюция: новые горизонты. Материалы Междунар. симп., посвященного 100-летию академика С.С. Шварца. Екатеринбург, 2019. С. 338–340.
  4. 4. Семерикова С.А., Исаков И.Ю., Семериков В.Л. Изменчивость хлоропластной ДНК и филогеография дуба черешчатого Quercus robur L. в восточной части ареала // Генетика. 2021. Т. 57. № 1. С. 56–71.
  5. 5. Семериков Л.Ф. Популяционная структура древесных растений (на примере видов дуба европейской части СССР и Кавказа). М.: Наука, 1986. 140 с.
  6. 6. Сиволапов В.А., Воробьева Е.А., Вепринцев В.Н., Кулаков Е.Е. Оценка генетического разнообразия дуба черешчатого в Российской Федерации с применением ДНК-анализа // Тр. Санкт-Петербургского научно-исслед. ин-та лесного хозяйства. 2024. № 2. С. 99–107.
  7. 7. Янбаев Ю.А., Ивашов А.В., Редькина Н.Н. и др. О генетическом разнообразии у дуба черешчатого из Крыма // Вестник Башкирского ун-та. 2014. Т. 19. № 4. С. 1208–1211.
  8. 8. Падутов В.Е. Процессы гибридизации дуба черешчатого и дуба скального по результатам молекулярно-генетического анализа // Тр. БГТУ. Серия 1. Лесное хозяйство, природопользование и переработка возобновляемых ресурсов. 2021. № 2 (246). С. 93–102.
  9. 9. Деген Б., Янбаев Ю.А., Янбаев Р.Ю. и др. Генетическая изменчивость дуба черешчатого в природных популяциях разного происхождения // Вестник Башкирского гос. аграрного ун-та. 2020. № 4 (56). С. 32–36.
  10. 10. Калаев В.Н., Игнатова И.В., Кулакова Н.Ю. и др. Цитогенетический полиморфизм семенного потомства дуба черешчатого в условиях антропогенного загрязнения г. Москвы // Лесоведение. 2022. № 2. С. 172–187.
  11. 11. Деген Б., Янбаев Р.Ю., Муллагулов Р.Ю., Редькина Н.Н. Полиморфизм микросателлитных локусов у дуба черешчатого // Вестник Башкирского ун-та. 2013. Т. 18. № 4. С. 1037–1038.
  12. 12. Попова А.А. Цитогенетический полиморфизм семенного потомства дуба черешчатого на территориях с разной антропогенной нагрузкой // В мире научных открытий. 2010. № 6–1 (12). С. 327–330.
  13. 13. Кулаков Е.Е., Воробьева Е.А., Сиволапов В.А., Карпеченко Н.А. Оценка полиморфизма дуба черешчатого (Quercus robur) с помощью SSR-анализа // Лесной вестник. 2021. Т. 25. № 4. С. 44–51.
  14. 14. Деген Б., Янбаев Ю.А., Янбаев Р.Ю. и др. О возможности применения нового набора локусов однонуклетидных полиморфизмов для оптимизации лесосеменного районирования дуба черешчатого // Экобиотех. 2020. Т. 3. № 4. С. 604–608.
  15. 15. Габитова А.А., Янбаев Р.Ю., Редькина Н.Н. О высоком генетическом полиморфизме популяции дуба черешчатого на западном макросклоне Южного Урала // Вестник Башкирского ун-та. 2015. Т. 20. № 3. С. 854–856.
  16. 16. Янбаев Ю.А., Бахтина С.Ю., Янбаев Р.Ю. и др. Полиморфизм локусов SNP в российских популяциях дуба черешчатого // Вестник Башкирского гос. аграрного ун-та. 2020. № 1 (53). С. 51–55.
  17. 17. Plomion C., Aury J., Amselem J. et al. Oak genome reveals facets of long lifespan // Nat. Plants. 2018. V. 4. P. 440–452.
  18. 18. Гревцова В.В. Дубрава Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина РАН: история, состояние и перспективы // Ландшафтная архитектура и формирование комфортной городской среды. Материалы XVIII Всерос. научно-практ. конф. Нижний Новгород, 2022. С. 56–63.
  19. 19. Карписонова Р.А. Дубравы лесопарковой зоны Москвы. М.: Наука, 1967. 104 с.
  20. 20. Михно В.Б., Харченко Н.Н., Царалунга В.В. и др. Деградация дубрав Центрального Черноземья. Воронеж.: Воронеж. гос. лесотехн. ун-т им. Г.Ф. Морозова, 2010. 604 с.
  21. 21. Ландшафтная архитектура Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина РАН: история и перспективы. К 70-летию со дня образования / Под ред. Демидова А.С. М.: Тов-во науч. изданий КМК, 2015. 199 с.
  22. 22. Мурзин-Гундоров В.В., Уханова П.С. Отдельные аспекты природопользования в культурно-историческом контексте территории усадьбы Останкино // ББК 26.8 Р27. 2022. С. 413–416.
  23. 23. Рациональное природопользование: традиции и инновации: Материалы III Междунар. конф. (Москва, МГУ, 20–22 октября 2022 г.). М.: Наука, 2022. 554 с.
  24. 24. Уханова Е.В., Еремина О.И. Образ усадьбы в фотографиях и воспоминаниях графов Шереметевых. В собрании музея-усадьбы Останкино. М.: Кучково поле Музеон, 2020. 248 с.
  25. 25. Альбом участников Всероссийской промышленной и художественной выставки в Н. Новгороде в 1896 г. С.-Петербург, 1896. 468 с.
  26. 26. Мещенина А.А. Историк по призванию (к биографии С. Д. Шереметева) // Тр. истор. ф-та Санкт-Петербургского ун-та. 2010. № 2. С. 45–62.
  27. 27. Семенова-Прозоровская Е.А. Реконструкция части ансамбля-памятника истории и культуры XVIII века Останкино // Вестник МГУЛ. Лесной вестник. 1998. № 4. С. 33–45.
  28. 28. Печенкина В.С., Ворончихин В.А., Гревцова В.В. Особенности почвы Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина // Наукосфера. 2020. № 12–2. С. 94–97.
  29. 29. Тюрмер К.Ф. Пятьдесят лет лесохозяйственной практики. М.: Книжный магазин И. Дейбнера, 1891. 183 с.
  30. 30. Проект санитарно-оздоровительных мероприятий на территории Главного ботанического сада АН СССР в г. Москве. Пояснительная записка. Книга 1. М.: 1988, 127 с. Архив ГБС РАН. Инв. № 104/7-1-1.
  31. 31. Alikhani L., Rahmani M.S., Shabanian N. et al. Genetic variability and structure of Quercus brantii assessed by ISSR, IRAP and SCoT markers // Gene. 2014. V. 552. № 1. P. 176–183. https://doi.org/10.1016/j.gene.2014.09.034
  32. 32. Янбаев Р.Ю. О лесовосстановительных процессах в дубравах Южного Урала по данным ISSR-анализа // Вестник Башкирского ун-та. 2016. Т. 21. № 4. С. 943–946.
  33. 33. Kritskaya T.A., Kashin A.S., Perezhogin Y.V. et al. Genetic diversity of Tulipa suaveolens (Liliaceae) and its evolutionary relationship with early cultivars of T. gesneriana // Plant Syst. Evol. 2020. V. 306. P. 33. https://doi.org/10.1007/s00606-020-01667-7
  34. 34. Zelenova O.B., Galkina M.A., Onipchenko V.G., Schanzer I.A. Genetic differentiation and clonality in a local population of the caucasian endemic Trifolium polyphyllum C.A. Mey. (Fabaceae) // Russ. J. Genet. 2024. V. 60. P. 69–79. https://doi.org/10.1134/S1022795424010137
  35. 35. Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Mol. Biol. 1985. № 5. P. 69–76.
  36. 36. Buntjer J.B. Cross Checker: Computer assisted scoring of genetic AFLP data [Electronic resource]. Plant & Animal Genome VIII Conf. San Diego, CA. January 9–12, 2000. Mode of access: http://wheat.pw.usda.gov/jag/papers99/paper599/ indexp599.html
  37. 37. O’Hanlon P.C., Peakall R.A. A simple method for detection of size homoplasy among amplified fragment lengh polymorphism fragments // Mol. Ecol. 2000. V. 9. P. 815–816.
  38. 38. Rossello J.A., CebriAn M.C., Mayol M. Testing taxonomic and biogeographical relationship in a narrow Mediterranean endemic complex (Hippocrepis balearica) using RAPD markers // Ann. Bot. 2002. V. 89. P. 321–327.
  39. 39. Hammer O. Paleontological Statistics. Version 4.05. Reference Manual. Natural History Museum. Oslo, 2021. 284 p.
  40. 40. Шанцер И.А., Кутлунина Н.А. Межвидовая гибридизация у шиповников (Rosa L.) секции Caninae DC // Изв. РАН. Серия биол. 2010. № 5. С. 564–573.
  41. 41. Степанова Н.Ю., Федорова А.В., Шанцер И.А. О генетической структуре популяций Eversmannia subspinosa в России // Turczaninowia. 2023. № 1. С. 83–94.
  42. 42. Szucs M., Szabó F., Bán B. et al. Assessment of genetic diversity and phylogenetic relationship of Limousin herds in Hungary using microsatellite markers // Asian-Austral. J. Anim. Sci. 2019. V. 32. № 2. P. 176–182.
  43. 43. Чесноков Ю.В., Косолапов В.М. Генетические ресурсы растений и ускорение селекционного процесса. М.: ООО «Угрешская типография», 2016. 172 с.
  44. 44. Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Notes. 2006. V. 6. P. 288–295.
  45. 45. Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics. 1964. V. 49. № 4. P. 725–738.
  46. 46. Nei M. Genetic distance between populations // Am. Naturalist. 1972. V. 106. P. 283–292.
  47. 47. Alexandre H., Truffaut L., Klein E. et al. How does contemporary selection shape oak phenotypes? // Evol. Appl. 2020. V. 10. P. 2772–2790. https://doi.org/10.1111/eva.13082
  48. 48. Супрун И.И., Степанов И.В., Соколова В.В., Аль-Накиб Е.А. Анализ генетического разнообразия селекционно-ценных форм ореха грецкого из коллекции Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина РАН с использованием SSR-маркеров // Садоводство и виноградарство. 2022. № 6. С. 16–23.
  49. 49. Царалунга В.В., Царалунга А.В. Долголетие деревьев дуба и дубовых древостоев // Лесотехн. журн. 2017. № 1 (25). С. 25–33.
  50. 50. Sork V., Davis F., Smouse P. et al. Pollen movement in declining populations of California Valley oak, Quercus lobata: where have all the fathers gone? // Mol. Ecol. 2002. V. 11. P. 1657–1668.
  51. 51. Pluess A., Sork V., Dolan B. et al. Short distance pollen movement in a wind-pollinated tree, Quercus lobata (Fagaceae) // Forest Ecol. and Management. 2009. V. 258. P. 735–744. https://doi.org/10.1016/J.FORECO.2009.05.014
  52. 52. Сладков А.Н. Введение в спорово-пыльцевой анализ. М.: Наука, 1967. 275 с.
  53. 53. Мазей Н.Г., Кусильман М.В., Новенко Е.Ю. Встречаемость пыльцы Carpinus, Fagus, Tilia и Quercus в субрецентных спорово-пыльцевых спектрах Восточно-Европейской равнины: к вопросу о возможности дальнего заноса пыльцы // Экология. 2018. № 6. С. 431–439.
  54. 54. Заклинская Е.Д. Материалы к изучению состава современной растительности и ее спорово-пыльцевых спектров для целей биостратиграфии четвертичных отложений (широколиственный и смешанный лес) // Тр. Ин-та геолог. наук. Вып. 127. Геологическая серия № 48. 1951. 101 с.
  55. 55. Schueler S., Schlünzen K. Modeling of oak pollen dispersal on the landscape level with a mesoscale atmospheric model // Environmental Modeling & Assessment. 2006. V. 11. P. 179–194.
  56. 56. Федорова Р.В., Вронский В.А. О закономерностях рассеивания пыльцы и спор в воздухе (для целей палеогеографических реконструкций) // БКИЧП. 1980. № 50. С. 153–165.
  57. 57. Kremer A. Did early human population in Europe facilitate the dispersion of oak? // J. Intern. Oak Society. 2015. V. 26. P. 19–28.
  58. 58. Chasse B. Eating acorns: What story do the distant, far, and near past tell us, and why? // J. Intern. Oak Society. 2016. V. 27. P. 107–135.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека