- PII
- S3034510325100087-1
- DOI
- 10.7868/S3034510325100087
- Publication type
- Article
- Status
- Published
- Authors
- Volume/ Edition
- Volume 61 / Issue number 10
- Pages
- 99-107
- Abstract
- A comparative analysis of the genetic structure of domesticated reindeer populations of the Chukotka and Koryak Highlands (northeastern edge of the species range) was performed using a panel of 16 microsatellite loci. The statistical analysis data show a high level of consolidation of the studied Chukotka reindeer breed and a high degree of differentiation with the breeds of the western and central parts of the range. One of the important objectives of the study was to monitor the genetic structure of the populations of the Chukotka and Evenki reindeer breeds, based on a comparative analysis of samples from populations of the mid-20th century and modern populations. The obtained research results indicate a high level of stability of the main indicators of the genetic structure of the species.
- Keywords
- Rangifer tarandus STR-маркеры мониторинг миграции пространственно-генетическая структура популяций
- Date of publication
- 01.10.2025
- Year of publication
- 2025
- Number of purchasers
- 0
- Views
- 26
References
- 1. Энциклопедия Якутии // Якутск: ЯНЦ СО РАН, 2007. Т. 2. С. 405–415.
- 2. Коломиец О.П., Нувано В.Н. Чукотское оленеводство в конце XIX — первой половине XX века // Томский журнал лингвистических и антропол. исследований. 2017. № 4(18). С. 76–88. https://doi.org/10.23951/2307-6119-2017-4-76-88
- 3. Сыроечковский Е.Е. Северный олень // М.: Агропромиздат, 1986. 256 с.
- 4. Давыдов В.Н. От дикого к домашнему: стратегии доместикации оленя в Северном Забайкалье // Радловский сборник. Научные исследования и музейные проекты МАЭ РАН в 2013 г. 2014. С. 365–371.
- 5. Борисов В.Д., Борисова Т.Д. Особенности управления оленеводством в Республике Саха (Якутия) // Пробл. соврем. экономики. 2017. № 3(63). С. 170–174.
- 6. Столповский Ю.А., Бабаян О.В., Каштанов С.Н. и др. Генетическая оценка пород северного оленя (Rangifer tarandus) и их дикого предка с помощью панели STR-маркеров // Генетика. 2020. Т. 56. № 12. С. 1410–1426. https://doi.org/10.31857/S0016675820120139
- 7. Семина М.Т., Каштанов С.Н., Бабаян О.В. и др. Анализ генетического разнообразия и популяционной структуры ненецкой аборигенной породы северных оленей на основе микросателлитных маркеров // Генетика. 2022. Т. 58. № 8. С. 954–966. https://doi.org/10.31857/S0016675822080069
- 8. Svishcheva G.R., Babayan O.V., Sipko T.P. et al. Genetic differentiation between coexisting wild and domestic reindeer (Rangifer tarandus L. 1758) in Northern Eurasia // Genetic Resources. 2022. V. 3. № 6. P. 1–14. https://doi.org/10.46265/genresj.UVML5006
- 9. Каштанов С.Н., Захаров Е.С., Семина М.Т. и др. Генетическая структура доместицированных популяций северного оленя (Rangifer tarandus) Среднесибирского плоскогорья и прилегающих территорий // Генетика. 2024. Т. 60. № 1. С. 94–99. https://doi.org/10.31857/S0016675824010076
- 10. Kharyinova V.R., Dotsev A.V., Deniskova T.E. et al. Genetic diversity and population structure of domestic and wild reindeer (Rangifer tarandus L. 1758): A novel approach using Bovine HDBead Chip // PLoS One. 2018. V. 13(11). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0207944
- 11. Харьянова В.Р., Зиновьева Н.А. Применение микросателлитов в популяционно-генетических исследованиях северного оленя (Rangifer tarandus) // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2024. Т. 25(4). С. 525–537. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2024.25.4.525–537
- 12. Доброхотов В.В., Павлова Н.И., Румянцева Т.Д., Калашникова Л.А. Генетическая характеристика чукотской породы оленей на территории Якутии // Генетика и разведение животных. 2020. № 3. С. 27–32. https://doi.org/10.31043/2410-2733-2020-3-27-32
- 13. Кошкина О.А., Соловьев А.Д., Денискова Т.Е. и др. Изучение генетического разнообразия домашних и диких популяций северного оленя (Rangifer tarandus L. 1758) с использованием маркеров ядерного и митохондриального геномов // С.-хоз. биология. 2022. Т. 57. № 6. С. 1101–1116. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2022.6.1101rus
- 14. Грузов А.Р., Сипко Т.П. Северный олень (Rangifer tarandus L.) острова Врангеля: динамика популяции и современное состояние // Природа острова Врангеля: современные исследования. Сб. науч. трудов. СПб: 2007. С. 117–135.
- 15. R Development Core Team. R: A language and environment for statistical computing // R Foundation for Statistical Computing. Austria, Vienna. 2014.
- 16. Keenan K., McGinnity Ph., Tom F.C. et al. DiveRsity: An R package for the estimation and exploration of population genetics parameters and their associated errors // Meth. Ecol. Evol. 2013. V. 4. P. 782–788. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12067
- 17. Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: Simplifying basic population genetic analyses in R // Meth. Ecol. Evol. 2014. V. 5. P. 384–387. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12158
- 18. Jost L. G and its relatives do not measure differentiation // Mol. Ecol. 2008. V. 17. № 18. P. 4015–4026. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2008.03887.x
- 19. Jueterboe A., Kraemer P., Gerlach G. et al. Package ‘DEMEtics’ // Mol. Ecol. 2012. P. 3845–3852.
- 20. Nei M. Genetic distance between populations // Am. Nat. 1972. V. 106. P. 283–292.
- 21. Kamvar Z.N., Tabima J.F., Grünwald N.J. Poppr: An R package for genetic analysis of populations with clonal, partially clonal, and/or sexual reproduction // Peer J. 2014. V. 2. https://doi.org/10.7717/peerj.281
- 22. Puechmaille S.J. The program structure does not reliably recover the correct population structure when sampling is uneven: Subsampling and new estimators alleviate the problem // Mol. Ecol. Res. 2016. V. 16. № 3. P. 608–627. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12512
- 23. Evanno G., Regnau S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: A simulation study // Mol. Ecol. 2005. V. 14. № 8. P. 2611–2620. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x
- 24. Raj A., Stephens M., Pritchard J.K. Fast STRUCTURE: Variational inference of population structure in large SNP data sets // Genetics. 2014. V. 197. № 2. P. 573–589. https://doi.org/10.1534/genetics.114.164350
- 25. Kopelman N.M., Mayzel J., Jakobsson M. et al. Clumpak: A program for identifying clustering modes and packaging population structure inferences across K // Mol. Ecol. Res. 2015. V. 15. № 5. P. 1179–1191. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12387