RAS BiologyГенетика Russian Journal of Genetics

  • ISSN (Print) 0016-6758
  • ISSN (Online) 3034-5103

Monitoring the Genetic Structure of Domesticated Reindeer ( L.): Mainland and Island Populations of the North-East of Russia

PII
S3034510325100087-1
DOI
10.7868/S3034510325100087
Publication type
Article
Status
Published
Authors
Volume/ Edition
Volume 61 / Issue number 10
Pages
99-107
Abstract
A comparative analysis of the genetic structure of domesticated reindeer populations of the Chukotka and Koryak Highlands (northeastern edge of the species range) was performed using a panel of 16 microsatellite loci. The statistical analysis data show a high level of consolidation of the studied Chukotka reindeer breed and a high degree of differentiation with the breeds of the western and central parts of the range. One of the important objectives of the study was to monitor the genetic structure of the populations of the Chukotka and Evenki reindeer breeds, based on a comparative analysis of samples from populations of the mid-20th century and modern populations. The obtained research results indicate a high level of stability of the main indicators of the genetic structure of the species.
Keywords
Rangifer tarandus STR-маркеры мониторинг миграции пространственно-генетическая структура популяций
Date of publication
01.10.2025
Year of publication
2025
Number of purchasers
0
Views
26

References

  1. 1. Энциклопедия Якутии // Якутск: ЯНЦ СО РАН, 2007. Т. 2. С. 405–415.
  2. 2. Коломиец О.П., Нувано В.Н. Чукотское оленеводство в конце XIX — первой половине XX века // Томский журнал лингвистических и антропол. исследований. 2017. № 4(18). С. 76–88. https://doi.org/10.23951/2307-6119-2017-4-76-88
  3. 3. Сыроечковский Е.Е. Северный олень // М.: Агропромиздат, 1986. 256 с.
  4. 4. Давыдов В.Н. От дикого к домашнему: стратегии доместикации оленя в Северном Забайкалье // Радловский сборник. Научные исследования и музейные проекты МАЭ РАН в 2013 г. 2014. С. 365–371.
  5. 5. Борисов В.Д., Борисова Т.Д. Особенности управления оленеводством в Республике Саха (Якутия) // Пробл. соврем. экономики. 2017. № 3(63). С. 170–174.
  6. 6. Столповский Ю.А., Бабаян О.В., Каштанов С.Н. и др. Генетическая оценка пород северного оленя (Rangifer tarandus) и их дикого предка с помощью панели STR-маркеров // Генетика. 2020. Т. 56. № 12. С. 1410–1426. https://doi.org/10.31857/S0016675820120139
  7. 7. Семина М.Т., Каштанов С.Н., Бабаян О.В. и др. Анализ генетического разнообразия и популяционной структуры ненецкой аборигенной породы северных оленей на основе микросателлитных маркеров // Генетика. 2022. Т. 58. № 8. С. 954–966. https://doi.org/10.31857/S0016675822080069
  8. 8. Svishcheva G.R., Babayan O.V., Sipko T.P. et al. Genetic differentiation between coexisting wild and domestic reindeer (Rangifer tarandus L. 1758) in Northern Eurasia // Genetic Resources. 2022. V. 3. № 6. P. 1–14. https://doi.org/10.46265/genresj.UVML5006
  9. 9. Каштанов С.Н., Захаров Е.С., Семина М.Т. и др. Генетическая структура доместицированных популяций северного оленя (Rangifer tarandus) Среднесибирского плоскогорья и прилегающих территорий // Генетика. 2024. Т. 60. № 1. С. 94–99. https://doi.org/10.31857/S0016675824010076
  10. 10. Kharyinova V.R., Dotsev A.V., Deniskova T.E. et al. Genetic diversity and population structure of domestic and wild reindeer (Rangifer tarandus L. 1758): A novel approach using Bovine HDBead Chip // PLoS One. 2018. V. 13(11). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0207944
  11. 11. Харьянова В.Р., Зиновьева Н.А. Применение микросателлитов в популяционно-генетических исследованиях северного оленя (Rangifer tarandus) // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2024. Т. 25(4). С. 525–537. https://doi.org/10.30766/2072-9081.2024.25.4.525–537
  12. 12. Доброхотов В.В., Павлова Н.И., Румянцева Т.Д., Калашникова Л.А. Генетическая характеристика чукотской породы оленей на территории Якутии // Генетика и разведение животных. 2020. № 3. С. 27–32. https://doi.org/10.31043/2410-2733-2020-3-27-32
  13. 13. Кошкина О.А., Соловьев А.Д., Денискова Т.Е. и др. Изучение генетического разнообразия домашних и диких популяций северного оленя (Rangifer tarandus L. 1758) с использованием маркеров ядерного и митохондриального геномов // С.-хоз. биология. 2022. Т. 57. № 6. С. 1101–1116. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2022.6.1101rus
  14. 14. Грузов А.Р., Сипко Т.П. Северный олень (Rangifer tarandus L.) острова Врангеля: динамика популяции и современное состояние // Природа острова Врангеля: современные исследования. Сб. науч. трудов. СПб: 2007. С. 117–135.
  15. 15. R Development Core Team. R: A language and environment for statistical computing // R Foundation for Statistical Computing. Austria, Vienna. 2014.
  16. 16. Keenan K., McGinnity Ph., Tom F.C. et al. DiveRsity: An R package for the estimation and exploration of population genetics parameters and their associated errors // Meth. Ecol. Evol. 2013. V. 4. P. 782–788. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12067
  17. 17. Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: Simplifying basic population genetic analyses in R // Meth. Ecol. Evol. 2014. V. 5. P. 384–387. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12158
  18. 18. Jost L. G and its relatives do not measure differentiation // Mol. Ecol. 2008. V. 17. № 18. P. 4015–4026. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2008.03887.x
  19. 19. Jueterboe A., Kraemer P., Gerlach G. et al. Package ‘DEMEtics’ // Mol. Ecol. 2012. P. 3845–3852.
  20. 20. Nei M. Genetic distance between populations // Am. Nat. 1972. V. 106. P. 283–292.
  21. 21. Kamvar Z.N., Tabima J.F., Grünwald N.J. Poppr: An R package for genetic analysis of populations with clonal, partially clonal, and/or sexual reproduction // Peer J. 2014. V. 2. https://doi.org/10.7717/peerj.281
  22. 22. Puechmaille S.J. The program structure does not reliably recover the correct population structure when sampling is uneven: Subsampling and new estimators alleviate the problem // Mol. Ecol. Res. 2016. V. 16. № 3. P. 608–627. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12512
  23. 23. Evanno G., Regnau S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: A simulation study // Mol. Ecol. 2005. V. 14. № 8. P. 2611–2620. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x
  24. 24. Raj A., Stephens M., Pritchard J.K. Fast STRUCTURE: Variational inference of population structure in large SNP data sets // Genetics. 2014. V. 197. № 2. P. 573–589. https://doi.org/10.1534/genetics.114.164350
  25. 25. Kopelman N.M., Mayzel J., Jakobsson M. et al. Clumpak: A program for identifying clustering modes and packaging population structure inferences across K // Mol. Ecol. Res. 2015. V. 15. № 5. P. 1179–1191. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12387
QR
Translate

Indexing

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Higher Attestation Commission

At the Ministry of Education and Science of the Russian Federation

Scopus

Scientific Electronic Library