References

1. 1. Prufer K., de Filippo C., Grote S. et al. A high-coverage Neandertal genome from Vindija Cave in Croatia // Science. 2017. V. 358. № 6363. P. 655–658. https://doi.org/10.1126/science.aao1887
2. 2. Mafessoni F., Grote S., de Filippo C. et al. A high-coverage Neandertal genome from Chagyrskaya Cave // PNAS USA. 2020. V. 117. № 26. P. 15132–15136. https://doi.org/10.1073/pnas.2004944117
3. 3. Reich D., Green R., Kircher M. et al. Genetic history of an archaic hominid group from Denisova cave in Siberia // Nature. 2010. № 468. P. 1053–1060. https://doi.org/10.1038/nature09710
4. 4. Furholt M. Mobility and social change: Understanding the European neolithic period after the archaeogenetic revolution // J. Archaeol. Res. 2021. № 29. P. 481–535. https://doi.org/10.1007/s10814-020-09153-x
5. 5. Lazaridis I., Patterson N., Anthony D. et al. The genetic origin of the Indo-Europeans // Nature. 2025. № 639. P. 132–142. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08531-5
6. 6. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Moliaka Y.K. et al. Genomic identification in the historical case of the Nicholas II royal family // PNAS USA. 2009. V. 106. № 13. P. 5258–5263. https://doi.org/10.1073/pnas.0811190106
7. 7. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Faskhutdinova G. et al. Genotype analysis identifies the cause of the “royal disease” // Science. 2009. V. 326. № 5954. P. 817. https://doi.org/10.1126/science.1180660
8. 8. Андреева Т.В., Манахов А.Д., Кунижева С.С., Рогаев Е.И. Генетическое свидетельство аутентичности локона волос, представленного как реликвия в музейном портрете цесаревича Алексея, сына последнего российского императора // Биохимия. 2021. № 86. С. 1818–1825. https://doi.org/10.31857/S032097252112006X
9. 9. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Сошкина А.Д. и др. Методологии выделения древней ДНК из костной ткани для геномного анализа: подходы и практические рекомендации // Генетика. 2022. Т. 58. № 9. С. 979–998. https://doi.org/10.31857/S001667582209003X
10. 10. Prufer K., Stenzel U., Hofreiter M. et al. Computational challenges in the analysis of ancient DNA // Genome Biol. 2010. V. 11. № 5. https://doi.org/10.1186/gb-2010-11-5-r47
11. 11. Rogaev E.I., Moliaka Y.K., Malyarchuk B.A. et al. Complete mitochondrial genome and phylogeny of pleistocene mammoth Mammuthus primigenius // PLoS Biol. 2006. V. 4. № 3. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040073
12. 12. Andreeva T.V., Manakhov A.D., Gusev F.E. et al. Genomic analysis of a novel neandertal from Mezmaiskaya Cave provides insights into the genetic relationships of middle palaeolithic populations // Sci. Rep. 2022. V. 12. P. 13016. https://doi.org/10.1038/s41598-022-16164-9
13. 13. Андреева Т.В., Жилин М.Г., Малярчук А.Б. и др. Археогеномиз человека из слоя верхневолжской культуры – наибольшее генетическое сходство с восточно-европейскими охотниками-собирателями и древними представителями мезолита/неолита Европы // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2024. № 1(64). С. 113–125. https://doi.org/10.20874/2071-0437-2024-64-1-10
14. 14. Andreeva T.V., Soshkina A.D., Gusev F.E. et al. Genetic history of Scythia // Sci. Adv. 2025 V. 11. P. 8179. http://doi.org/10.1126/sciadv.ads8179
15. 15. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Григоренко А.П. и др. Археогенетический анализ индивида из захоронения с территории древнего Ярославского Кремля // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2021. № 265. С. 294–308. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.265.294-308
16. 16. Андреева Т.В., Добровольская М.В., Седов В.В. и др. Люди из каменного саркофага № 11 Юрьева монастыря: генетическая история на основе митохондриальных геномов // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2023. № 270. С. 418–437. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.270.418-437
17. 17. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Родинкова В.Е. и др. Индивидуальный вектор времени из Куриловки: первые археогенетические данные // Рос. археология. 2023. № 3. С. 57–71. https://doi.org/10.31857/S0869606323030030
18. 18. Рождественских Е.В., Манахов А.Д., Андреева Т.В. и др. Юноша с хорьком из средневекового могильника Минино на Кубенском озере: археогенетическая идентификация // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2024. № 274. С. 348–368. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.274.348-368
19. 19. Сыроватко А.С., Андреева Т.В., Кунижева С.С. и др. Индивид из куранного погребения XII в. на Средней Оке – опыт комплексного археолого-генетического исследования // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2024. Т. 2. № 65. С. 123–136. https://doi.org/10.20874/2071-0437-2024-65-2-10
20. 20. Сошкина А.Д., Андреева Т.В., Кунижева С.С. и др. Генетическое исследование музейного антропологического образца из городского захоронения Старой Рязани XI–XIII веков // Генетика. 2025. Т. 61. № 6. С. 706–716. https://doi.org/10.1134/S1022795425700231
21. 21. Альперович А.И., Сошкина А.Д., Андреева Т.В. и др. Генетический портрет индивида из средневекового некрополя «Патриарший сад» (г. Владимир) с редкой погребальной обрадностью – каменной подушкой // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2025 (в печати).
22. 22. Рождественских Е.В., Андреева Т.В., Малярчук А.Б. и др. Митогеномный анализ представителя черняховской культуры в Среднем Поднестровье и его генетическая связь со славянами в контексте палеоантропологических данных // Вавилов. журн. генет. и селекции. 2025 (в печати).
23. 23. Малярчук А.Б., Кузнецова И.Л., Андреева Т.В. и др. Оценка возможности геномного исследования кремлированных археологических образцов // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2025 (в печати).
24. 24. Niirauen L., Leciej D., Edlund H. et al. Epigenomic modifications in modern and ancient genomes // Genes (Basel). 2022. V. 13. № 2. https://doi.org/10.3390/genes13020178
25. 25. Малярчук А.Б., Андреева Т.В., Кузнецова И.Л. и др. Геномика древних патогенов: первые успехи и перспективы // Биохимия. 2022. № 87. С. 242–258. https://doi.org/10.1134/S000629792030051