Везде

ОБНГенетика Russian Journal of Genetics

  • ISSN (Print) 0016-6758
  • ISSN (Online) 3034-5103

Генетические нарушения рака полости рта, ассоциированные с прогрессированием заболевания в молодом возрасте

Вы можете
Код статьи
S0016675825050064-1
DOI
10.31857/S0016675825050064
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Колегова Е. С.
  • Должность: <i>Консорциум «Этиология и патогенез рака полости рта у пациентов молодого возраста»</i>
  • Аффилиация: Научно-исследовательский институт онкологии Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук
Том/ Выпуск
Том 61 / Номер выпуска 5
Страницы
67-77
Аннотация
Плоскоклеточная карцинома полости рта (ПКПР) в молодом возрасте является агрессивным и быстропрогрессирующим заболеванием и не связана с такими традиционными факторами риска, как курение, употребление алкоголя или инфицирование вирусом папилломы человека (ВПЧ). Цель исследования – выявить генетические нарушения, связанные с прогрессированием ПКПР у молодых пациентов. В исследование вошли 25 молодых больных ПКПР, проживающих на территории РФ. Проведено полноэкзомное секвенирование образцов первичной опухоли и периферической крови с использованием набора для подготовки ДНК-библиотек SureSelect XT v8.0 на платформе Genolab M. Анализ однонуклеотидных вариантов (SNVs) и инсерций и делеций (indels) проводился с помощью пайплайна GATK; фильтрацию генетических вариантов в опухоли относительно таковых в периферической крови проводили с помощью пайплайна Mutect2; аннотацию мутаций проводили с помощью ANNOVAR. Статистическая обработка данных проводилась с использованием пакета компьютерной программы IBM SPSS Statistics 20. Для проверки мутаций, показавших статистически значимый результат в отношении безрецидивной, безметастатической и общей выживаемости, использовались данные Атласа генома рака (The Cancer Genome Atlas, N = 127). Выявлена прогностическая значимость соматических мутаций генов: TAF1L, CUL7, PRPS1L1 и CDKN2A – для безрецидивной выживаемости (p = 0.003, p = 0.003, p = 0.003 и p = 0.004 соответственно), PLEC и TEP1 – для безметастатической выживаемости (p < 0.001 и p = 0.007 соответственно) и ADGRL3, PREX1 и CDKN2A – для общей выживаемости (p = 0.023, p = 0.023 и p < 0.001 соответственно). Обнаружено, что все мутации в гене CDKN2A были со сдвигом рамки считывания или приводили к появлению стоп-кодона, был найден патогенный вариант rs121913387. Для гена CUL7 вариант rs369167170 был повторяющимся для пациентов с рецидивами, а для гена PLEC вариант в регионе 7:18027430 C>A был повторяющимся для пациентов с метастазами. Анализ данных Атласа генома рака подтвердил связь только мутаций гена CDKN2A с прогрессированием ПКПР в возрасте до 45 лет (N = 18, p = 0.049), но не у пациентов старшего возраста (N = 109). Выявлены генетические нарушения, связанные с прогрессированием ПКПР в молодом возрасте, которые требуют подтверждения своей значимости на большей выборке больных и оценки функциональной значимости.
Ключевые слова
рак полости рта молодой возраст прогрессирование рецидив мутация секвенирование
Дата публикации
06.11.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
50

Библиография

  1. 1. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I. et al. Global cancer statistics 2018: Globocan estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries // CA Cancer J. Clin. 2018. V. 68. № 6. P. 394–424. https://doi.org/10.3322/caac.21492
  2. 2. Sarode G., Maniyar N., Sarode S.C. et al. Epidemiologic aspects of oral cancer // Dis. Mon. 2020. V. 66. № 12. https://doi.org/10.1016/j.disamonth.2020.100988
  3. 3. Kolegova E.S., Patysheva M.R., Larionova I.V. et al. Early-onset oral cancer as a clinical entity: aetiology and pathogenesis // Int. J. Oral Maxillofac. Surg. 2022. V. 51. № 12. P. 1497–1509. https://doi.org/10.1016/j.ijom.2022.04.005
  4. 4. Ryu H.J., Kim E.K., Cho B.C., Yoon S.O. Characterization of head and neck squamous cell carcinoma arising in young patients: Particular focus on molecular alteration and tumor immunity // Head Neck. 2019. V. 41. № 1. P. 198–207. https://doi.org/10.1002/hed.25507
  5. 5. Campbell B.R., Sanders C.B., Netterville J.L. et al. Early onset oral tongue squamous cell carcinoma: Associated factors and patient outcomes // Head Neck. 2019. V. 41. № 6. P. 1952–1960. https://doi.org/10.1002/hed.25650
  6. 6. Mohideen K., Krithika C., Jeddy N. et al. Meta-analysis on risk factors of squamous cell carcinoma of the tongue in young adults // J. Oral Maxillofac. Pathol. 2019. V. 23. № 3. P. 450–457. https://doi.org/10.4103/jomfp
  7. 7. Braakhuis B.J., Rietbergen M.M., Buijze M. et al. TP53 mutation and human papilloma virus status of oral squamous cell carcinomas in young adult patients // Oral Dis. 2014. V. 20. № 6. P. 602–608. https://doi.org/10.1111/odi.12178
  8. 8. Rushatamukayanunt P., Morita K., Matsukawa S. et al. Lack of association between high-risk human papilloma viruses and oral squamous cell carcinoma in young Japanese patients // Asian Pac. J. Cancer Prev. 2014. V. 15. № 10. P. 4135–4141. https://doi.org/10.7314/apjcp.2014.15.10.4135
  9. 9. Weckx A., Riekert M., Grandoch A. et al. Time to recurrence and patient survival in recurrent oral squamous cell carcinoma // Oral Oncol. 2019. V. 94. P. 8–13. https://doi.org/10.1016/j.oraloncology.2019.05.002
  10. 10. Safi A.F., Kauke M., Grandoch A. et al. Analysis of clinicopathological risk factors for locoregional recurrence of oral squamous cell carcinoma – retrospective analysis of 517 patients // J. Craniomaxillofac. Surg. 2017. V. 45. № 10. P. 1749–1753. https://doi.org/10.1016/j.jcms.2017.07.012
  11. 11. Sorensen D.M., Lewark T.M., Haney J.L. et al. Absence of p53 mutations in squamous carcinomas of the tongue in nonsmoking and nondrinking patients younger than 40 years // Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg. 1997. V. 123. № 5. P. 503–506. https://doi.org/10.1001/archotol.1997.01900050051006
  12. 12. Pickering C.R., Zhang J., Neskey D.M. et al. Squamous cell carcinoma of the oral tongue in young non-smokers is genomically similar to tumors in older smokers // Clin. Cancer Res. 2014. V. 20. № 14. P. 3842–3848. https://doi.org/10.1158/1078-0432.ccr-14-0565
  13. 13. Lindenbergh-van der Plas M., Brakenhoff R.H., Kuik D.J. et al. Prognostic significance of truncating TP53 mutations in head and neck squamous cell carcinoma // Clin. Cancer Res. 2011. V. 17. № 11. P. 3733–3741. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-11-0183
  14. 14. Zhou C., Shen Z., Ye D. et al. The association and clinical significance of CDKN2A promoter methylation in head and neck squamous cell carcinoma: a meta-analysis // Cell Physiol. Biochem. 2018. V. 50. № 3. P. 868–882. https://doi.org/10.1159/000494473
  15. 15. Vettore A.L., Ramnarayanan K., Poore G. et al. Mutational landscapes of tongue carcinoma reveal recurrent mutations in genes of therapeutic and prognostic relevance // Genome Med. 2015. V. 7. № 1. P. 98. https://doi.org/10.1186/s13073-015-0219-2
  16. 16. Nakagaki T., Tamura M., Kobashi K. et al. Profiling cancer-related gene mutations in oral squamous cell carcinoma from Japanese patients by targeted amplicon sequencing // Oncotarget. 2017. V. 8. № 35. P. 59113–59122. https://doi.org/10.18632/oncotarget.19262
  17. 17. Zhang L., Zeng M., Fu B.M. Inhibition of endothelial nitric oxide synthase decreases breast cancer cell MDA-MB-231 adhesion to intact microvessels under physiological flows // Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 2016. V. 310. № 11. P. H1735–1747. https://doi.org/10.1152/ajpheart.00109.2016
  18. 18. Chen W.S., Bindra R.S., Mo A. et al. CDKN2A copy number loss is an independent prognostic factor in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma // Front. Oncol. 2018. V. 8. P. 95. https://doi.org/10.3389/fonc.2018.00095
  19. 19. Fan K., Dong Y., Li T., Li Y. Cuproptosis-associated CDKN2A is targeted by plicamycin to regulate the microenvironment in patients with head and neck squamous cell carcinoma // Front. Genet. 2022. V. 13. https://doi.org/10.3389/fgene.2022.1036408
  20. 20. Pickering C.R., Zhang J., Neskey D.M. et al. Squamous cell carcinoma of the oral tongue in young non-smokers is genomically similar to tumors in older smokers // Clin. Cancer Res. 2014. V. 20. № 14. P. 3842–3848. https://doi.org/10.1158/1078-0432
  21. 21. Paderno A., Morello R., Piazza C. Tongue carcinoma in young adults: A review of the literature // Acta Otorhinolaryngol. Ital. 2018. V. 38. № 3. P. 175–180. https://doi.org/10.14639/0392-100X-1932
  22. 22. Kimura J., Nguyen S.T., Liu H. et al. A functional genome-wide RNAi screen identifies TAF1 as a regulator for apoptosis in response to genotoxic stress // Nucl. Acids Res. 2008. V. 36. № 16. P. 5250–5259. https://doi.org/10.1093/nar/gkn506
  23. 23. Gao K., Gao Z., Xia M. et al. Role of plectin and its interacting molecules in cancer // Med. Oncol. 2023. V. 40. № 10. P. 280. https://doi.org/10.1007/s12032-023-02132-4
  24. 24. Pan Z.Q. Cullin-RING E3 ubiquitin ligase 7 in growth control and cancer // Adv. Exp. Med. Biol. 2020. V. 1217. P. 285–296. https://doi.org/10.1007/978-981-15-1025-0_17
  25. 25. Xu J., Zhang Z., Qian M. et al. Cullin-7 (CUL7) is overexpressed in glioma cells and promotes tumorigenesis via NF-κB activation // J. Exp. Clin. Cancer Res. 2020. V. 39. № 1. P. 59. https://doi.org/10.1186/s13046-020-01553-7
  26. 26. Jin D.H., Kim S., Kim D.H., Park J. Two genetic variants in telomerase-associated protein 1 are associated with stomach cancer risk // J. Hum. Genet. 2016. V. 61. № 10. P. 885–889. https://doi.org/10.1038/jhg.2016.71
  27. 27. Gu C., Li Q., Zhu Y. et al. Genetic variants in the TEP1 gene are associated with prostate cancer risk and recurrence // Prostate Cancer Prostatic Dis. 2015. V. 18. № 4. P. 310–316. https://doi.org/10.1038/pcan.2015.27
  28. 28. Avila-Zozaya M., Rodríguez-Hernández B., Monterrubio-Ledezma F. et al. Thwarting of lphn3 functions in cell motility and signaling by cancer-related GAIN domain somatic mutations // Cells. 2022. V. 11. № 12. https://doi.org/10.3390/cells11121913
  29. 29. Zhang H., Okuyama H., Jain A. et al. PREX1 improves homeostatic proliferation to maintain a naive CD4+ T cell compartment in older age // JCI Insight. 2024. V. 9. № 5. https://doi.org/10.1172/jci.insight.172848
  30. 30. Wan S.C., Wu H., Li H. et al. Overexpression of PREX1 in oral squamous cell carcinoma indicates poor prognosis // J. Mol. Histol. 2020. V. 51. № 5. P. 531–540. https://doi.org/10.1007/s10735-020-09901-9
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека