Везде

ОБНГенетика Russian Journal of Genetics

  • ISSN (Print) 0016-6758
  • ISSN (Online) 3034-5103

Исследование генетической дифференциации островных и материковых популяций полевой мыши (Apodemus agrarius Pallas, 1771) посредством анализа полиморфизма микросателлитов

Вы можете
Код статьи
S0016675825050046-1
DOI
10.31857/S0016675825050046
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Фрисман Л. В.
  • Аффилиация: Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук
Том/ Выпуск
Том 61 / Номер выпуска 5
Страницы
41-56
Аннотация
На основе микросателлитного анализа (по шести локусам) проведена оценка аллельного разнообразия и уровня генетической дифференциации популяций полевой мыши Apodemus agrarius в разных частях ареала вида. Исследованы полевые мыши четырех островов залива Петра Великого (Японское море), а также выборки из популяций крупных изолированных материковых массивов – восточного (шесть выборок из локалитетов юга Дальнего Востока России, одна сборная выборка из центральной части Китая) и западного (одна сборная выборка из Белгородской области). В островных и материковых популяциях обнаружено большое количество общих микросателлитных аллелей (62 из 84 выявленных). В островных популяциях по сравнению с континентальными наблюдаются обеднение аллельного состава и бóльшая мозаичность частот аллелей, в том числе уникальных. Полученные данные указывают на более высокий уровень дифференциации популяций полевых мышей на островах, отделенных проливами от материка и друг от друга в Голоцене, по сравнению с дифференциацией популяций обширных западного и восточного изолированных материковых массивов. Материковые изоляты генетически оказались дифференцированы друг от друга примерно в той же степени, что и пространственно разобщенные популяции юга Дальнего Востока России и Центрального Китая в пределах восточного изолята. Полученный результат предполагает относительно недавнее (возможно в период голоценового климатического оптимума) проникновение и быстрое распространение полевой мыши по территории Западной Сибири и Европы либо существование в истории вида нескольких «волн инвазий» в западном направлении.
Ключевые слова
полевая мышь островные и материковые изоляты микросателлиты аллельное разнообразие генетическая дифференциация
Дата публикации
06.11.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
61

Библиография

  1. 1. Карасёва Е.В., Тихонова Г.Н., Богомолов П.Л. Ареал полевой мыши (Apodemus agrarius) в СССР и особенности обитания вида в его разных частях // Зоол. журн. 1992. Т. 71. Вып. 6. С. 106–115.
  2. 2. Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. Санкт-Петербург, 1995. 522 с.
  3. 3. Musser G.G., Carleton M.D. Superfamily Muroidea // Mammal Species of the World: A Taxonomic and Geographic Reference», 3d ed./eds Wilson D.E., Reeder D.M. Baltimore, MD: Johns Hopkins Univ. Press, 2005. Р. 894–1531.
  4. 4. Khlyap L.A., Dinets V., Warshavsky A.A. et al. Aggregated occurrence records of the invasive alien striped field mouse (Apodemus agrarius Pall.) in the former USSR // Biodiversity Data J. 2021. V. 9. P. 1–19. https://doi.org/10.3897/BDJ.9.e69159
  5. 5. Хляп Л.А. Apodemus agrarius Pallas, 1771. Полевая мышь // Самые опасные инвазионные виды России (ТОП-100) / Под ред. Дгебуадзе Ю.Ю., Петросян В.Г., Хляп Л.А. М.: Тов-во научн. изданий КМК, 2018. C. 595–603.
  6. 6. Petrosyan V., Dinets V., Osipov F. et al. Range Dynamics of striped field mouse (Apodemus agrarius) in Northern Eurasia under global climate change based on ensemble species distribution models // Biology. 2023. V. 12. https://doi.org/10.3390/biology12071034
  7. 7. Карасёва Е.В. Apodemus agrarius Pallas, 1771 – полевая мышь // Медицинская териология. Под ред. Кучерук В.В. М.: Наука, 1979. С. 194–203.
  8. 8. Атопкин Д.М., Богданов А.С., Челомина Г.Н. Генетическая изменчивость и дифференциация полевой мыши Apodemus agrarius: результаты RAPD-PCR-анализа // Генетика. 2007. Т. 43. № 6. С. 804–817.
  9. 9. Фрисман Л.В., Богданов А.С., Картавцева И.В. и др. Дифференциация континентальных изолятов полевой мыши (Apodemus agrarius Pallas, 1771) по микросателлитным локусам // Журн. общей биологии. 2019. Т. 80. № 4. С. 274–285. https://doi.org/10.1134/S0044459619040055.
  10. 10. Latinne A., Navascues M., Pavlenko M. et al. Phylogeography of the striped field mouse (Apodemus agrarius) throughout the Palearctic Region // Mamm. Biology. 2020. P. 1–13. https://doi.org/10.1007/s42991-019-00001-0
  11. 11. Yalkovskaya L., Sibiryakov P., Borodin A. Phylogeography of the striped field mouse (Apodemus agrarius Pallas, 1771) in light of new data from central part of Northern Eurasia // PLoS One. 2022. 17 (10). P. 1–17. https://doi.org/10.1371
  12. 12. Suzuki H., Filippucci M., Chelomina G. et al. Biogeographic view of Apodemus in Asia and Europe inferred from nuclear and mitochondrial gene sequence // Biochem. Genet. 2008. V. 46. № 5–6. P. 329–346.
  13. 13. Kozyra K., Zaja T., Ansorge H. et al. Late Pleistocene expansion of small murid rodents across the Palearctic in relation to the past environmental Changes // Genes. 2021. V. 12. № 4. P. 642–669.
  14. 14. Kowalski K. Pleistocene rodents of Europe // Folia Quaternaria. 2001. V. 72. P. 3–389.
  15. 15. Popov V. Pleistocene record of Apodemus agrarius (Pallas, 1771) (Mammalia: Rodentia) in the Magura Cave, Bulgaria // Acta Zool. Bulg. 2017. V. 69. № 1. P. 121–124.
  16. 16. Велижанин А.Г. Время изоляции материковых островов северной части Тихого океана // Докл. АН СССР. 1976. Т. 231. № 1. С. 205–207.
  17. 17. Omelko V.E., Kuzmin Y.V., Tiunov M.P. et al. Late Pleistocene and Holocene small mammal (Lipotyphla, Rodentia, Lagomorpha) remains from Medvezhyi Klyk cave in the Southern Russian Far East // Proc. Zool. Institute RAS. 2020. V. 324 (1). P. 124–145. https://doi.org/10.31610/trudyzin/2020.324.1.124
  18. 18. Sakka H., Quéré J.P., Kartavtseva I. et al. Comparative phylogeography of four Apodemus species (Mammalia: Rodentia) in the Asian Far East: Evidence of Quaternary climatic changes in their genetic structure // Biol. J. Linnean Soc. 2010. V. 100. № 4. P. 797–821.
  19. 19. Шереметьев И.С. Формирование наземной териофауны островов залива Петра Великого (Японское море) // Вестник ДВО РАН. 2001. № 4. C. 11–21.
  20. 20. Aldjianabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt extraction of high quality genomic DNA for PCR based techniques // Nucl. Acids Res. 1997. V. 25. № 22. P. 4692–4693.
  21. 21. Makova K.D., Patton J.C., Krysanov E.Yu. et al. Microsatellite markers in wood mouse and striped field mouse (genus Apodemus) // Mol. Ecol. 1998. V. 7. P. 247–255.
  22. 22. Jo Y.S., Kim H.N., Baccus J.T., Jung J. Genetic differentiation of the Korean striped field mouse, Apodemus agrarius (Muridae, Rodentia), based on microsatellite polymorphism // Mammalia. 2016. V. 81. № 3. P. 1–11.
  23. 23. Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics. 1964. V. 49. P. 725–738.
  24. 24. Excoffier L.G., Laval C., Schneider S. Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis // Evol. Bioinform. 2005. V. 1. P. 47–50.
  25. 25. Brookfield J.F.Y. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency // Mol. Ecol. 1996. V. 5. P. 453–455.
  26. 26. Chapuis M.-P., Estoup A. Microsatellite null alleles and estimation of population differentiation // Mol. Biol. Evol. 2007. V. 24. № 3. P. 621–631. https://doi.org/10.1093/molbev/msl191
  27. 27. Cavalli-Sforza L.L., Edwards A.W.F. Phylogenetic analysis: Models and estimation procedures // Am. J. Hum. Genet. 1967. V. 19. P. 233–257.
  28. 28. Dempster A.P., Laird N.M., Rubin D.B. Maximum likelihood from incomplete data via the EM algorithm // J. R. Stat. Soc. B. 1977. V. 39. Р. 1–38.
  29. 29. Chakraborty R., De Andrade M., Daiger S.P., Budowle B. Apparent heterozygote deficiencies observed in DNA typing data and their implications in forensic applications // Ann. Hum. Genet. 1992. V. 56. P. 45–57.
  30. 30. Swofford D.R., Selander R.B. Biosys-1: А FORTRAN program for the comprehensive analysis of electrophoretic data in population genetic and systematic // J. Heredity. 1981. V. 72. № 4. P. 281–283.
  31. 31. Statistica 13 (18 и 19 TIBCO Software Inc.: Statistica 13. 2017. http://statistica.io)
  32. 32. Pritchard J.K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. 2000. V. 155. P. 945–959.
  33. 33. Earl D.A., von Holdt B.M. STRUCTURE HARVESTER: А website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Conservation Genet. Res. 2012. V. 4. № 2. Р. 359–361. https://doi.org/10.1007/s12686-011-9548-7
  34. 34. Kopelman N.M., Mayzel J., Jakobsson M. et al. Clumpak: А program for identifying clustering modes and packaging population structure inferences across K // Mol. Ecol. Res. 2015. V. 15. P. 1179–1191.
  35. 35. Фрисман Л.В., Шереметьева И.Н., Картавцева И.В. и др. Полиморфизм и уровень дифференциации островных и материковых популяций полевой мыши Apodemus agrarius юга Дальнего Востока России по данным анализа микросателлитов // Региональные проблемы. 2022. Т. 25. № 2. С. 3–15. https://doi.org/10.31433/2618-9593-2022-25-2-3-15
  36. 36. Дарвин Ч. Происхождение видов путём естественного отбора или сохранение благоприятных рас в борьбе за жизнь. M.: Издательство «Аст», 2017. 608 с.
  37. 37. Gillespie R.G., Claridge E.M., Roderick G.K. Biodiversity dynamics in isolated island communities: Interaction between natural and human-mediated processes // Mol. Ecol. 2008. V. 17. P. 45–57. https://doi.org/10.1111/J.1365-294X.2007.03466.X
  38. 38. Шереметьева И.Н., Картавцева И.В., Павленко М.В. и др. Морфологическая и генетическая изменчивость малых островных популяций полевой мыши Apodemus agrarius Pallas, 1771 // Изв. РАН. Серия биологическая. 2017. № 2. C. 129–141.
  39. 39. Хен Г.В. История открытия залива Петра Великого и океанографических исследований в Японском море до середины ХХ века // Изв. ТИНРО. 2020. Т. 200. Вып. 1. С. 3–23.
  40. 40. Aguilar J.-P., Pélissié Т., Sigé В., Michaux J. Occurrence of the Stripe Field Mouse lineage (Apodemus agrarius Рallas 1771, Rodentia, Mammalia) in the Late Pleistocene of southwestern France // Comptes Rendus Palevol V. 7. I. 4. P. 217–225. https://doi.org/10.1016/j.crpv.2008.02.004
  41. 41. Давид А.И., Чемыртан Г.Д. История развития териофауны Молдавии в голоцене // История биогеоценозов СССР в голоцене. М.: Наука, 1976. С. 207–213.
  42. 42. Ивакина Н.В., Струкова Т.В., Бородин А.В., Стефановский В.В. Некоторые материалы по становлению современных экосистем Среднего и Южного Зауралья // Палеонтол. журн. 1997. № 3. С. 25–29.
  43. 43. Богданов А.С., Мальцев А.Н., Котенкова Е.В. и др. Изменчивость фрагментов экзона 11 ядерного гена Brca1 и митохондриального гена Cox1 у домовых мышей Mus musculus // Мол. биология. 2020. Т. 54. № 2. С. 212–223.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека