By this author

Characterization of Feed Conversion by Sex Chromosomes Via Full Genome Association Study

Issue number 6 from 27.01.2025

Изучение количественных и качественных признаков с точки зрения генетической направленности невозможно без учета болезней или особенностей, сцепленных с полом. В настоящее время геномная селекция по половым хромосомам, проведенная методом полногеномного ассоциативного исследования, не была ключевым фактором для разработки специального кода и функциональной аннотации генов с учетом библиотек GO, KEGG и анализа ранее выявленных генов. Целью научно-практического исследования было создание программного кода для проведения GWAS по половым хромосомам свиней и поиск функционально значимых генов для объяснения связи «фенотип - генетика пола», которая в дальнейшем конкретизирует селекционный отбор свиней в нуклеус популяции и позволит заранее прогнозировать наследственные заболевания животных. В данной статье мы впервые провели GWA-анализ геномных оценок племенной ценности признака конверсии корма с учетом только половых хромосом (sGWAS). Структурная аннотация выявила 21 ген, расположенный на Х-хромосоме, и восемь генов - на Y-хромосоме, включая гомологичный участок XY. Проведенный кластерный анализ полученных генов обнаружил значимую взаимосвязь с коэффициентом конверсии корма у восьми из них: STS, DDX3X, PUDP, PNPLA4, DHRSX, GPR143, SHROOM2 и PRKX. Функциональная аннотация данных генов выявила их значительный вклад в биологические процессы организма, включая наследственные заболевания и специфичность сцепленных с полом.

94 0

Search for Selection Fingerprints in the Genome of Black-and-white Cattle Breeds Based on the Analysis of Whole-genome Sequences of Modern and Museum Samples

Issue number 11 from 01.11.2025

Дана оценка влияния искусственной селекции на изменчивость генома холмогорского и ярославского крупного рогатого скота на основании анализа полногеномных последовательностей современных и музейных образцов, датированных концом XIX — началом XX в. По результатам проведенного анализа 3403441 SNP установлено, что большинство выявленных отпечатков селекции в геноме исторического холмогорского и ярославского скота перекрывались с QTL молочной продуктивности. В современной холмогорской породе крупного рогатого скота доминирующее давление отбора на локусы, ассоциированные с молочной продуктивностью, сохранилось, в то время как в современной ярославской породе наряду с QTL молочной продуктивности действию отбора подвергались локусы, ассоциированные с репродуктивными качествами.

35 0