By this author

Analysis by minigene assay of the splicing effect of a novel variant c.1545T>G in the <i>SLC26A4</i> gene associated with hearing loss

Issue number 5 from 06.11.2025

Патогенные варианты в гене SLC26A4 (OMIM #605646, 21 экзон), кодирующем трансмембранный белок пендрин, являются одной из наиболее значимых генетических причин потери слуха. Известно, что около 25% всех известных патогенных SLC26A4-вариантов, локализованных как в интронных, так и экзонных областях (вблизи экзон-интронных границ) гена, приводят к нарушению сплайсинга. При детальном анализе гена SLC26A4 у тувинских пациентов с потерей слуха (Республика Тыва, Южная Сибирь) был выявлен специфический спектр вариаций, включающий как уже известные патогенные варианты, так и новые варианты с пока неясным клиническим значением. Один из новых вариантов, c.1545T>G, локализован в потенциально «чувствительной» для сплайсинга позиции (1-ый нуклеотид в экзоне 14). Сегрегация этого варианта с потерей слуха, выявленная при анализе родословных пациентов, и значимое превышение его частоты в выборке пациентов по сравнению с контрольной выборкой свидетельствуют в пользу его патогенной значимости. Целью данной работы является анализ эффекта нового варианта c.1545T>G гена SLC26A4 на процесс сплайсинга с использованием генетических конструкций – минигенов. Была создана система минигенов, включающих анализируемый вариант c.1545T>G и вариант дикого типа. Исследование проведено на клеточной линии HEK293T и повторено на клетках HeLa и SW480. При сравнительном анализе паттернов сплайсинга в минигенах с вариантом c.1545T>G и дикого типа различий не было выявлено. Таким образом, вариант c.1545T>G гена SLC26A4 не приводит к нарушению сплайсинга, а его патогенный эффект может быть связан с заменой фенилаланина (Phe) на лейцин (Leu) в 515-ой аминокислотной позиции (p.Phe515Leu) белка пендрина.

52 0