By this author

Genetic alterations of oral cancer associated with progression in young adults

Issue number 5 from 06.11.2025

Плоскоклеточная карцинома полости рта (ПКПР) в молодом возрасте является агрессивным и быстропрогрессирующим заболеванием и не связана с такими традиционными факторами риска, как курение, употребление алкоголя или инфицирование вирусом папилломы человека (ВПЧ). Цель исследования – выявить генетические нарушения, связанные с прогрессированием ПКПР у молодых пациентов. В исследование вошли 25 молодых больных ПКПР, проживающих на территории РФ. Проведено полноэкзомное секвенирование образцов первичной опухоли и периферической крови с использованием набора для подготовки ДНК-библиотек SureSelect XT v8.0 на платформе Genolab M. Анализ однонуклеотидных вариантов (SNVs) и инсерций и делеций (indels) проводился с помощью пайплайна GATK; фильтрацию генетических вариантов в опухоли относительно таковых в периферической крови проводили с помощью пайплайна Mutect2; аннотацию мутаций проводили с помощью ANNOVAR. Статистическая обработка данных проводилась с использованием пакета компьютерной программы IBM SPSS Statistics 20. Для проверки мутаций, показавших статистически значимый результат в отношении безрецидивной, безметастатической и общей выживаемости, использовались данные Атласа генома рака (The Cancer Genome Atlas, N = 127). Выявлена прогностическая значимость соматических мутаций генов: TAF1L, CUL7, PRPS1L1 и CDKN2A – для безрецидивной выживаемости (p = 0.003, p = 0.003, p = 0.003 и p = 0.004 соответственно), PLEC и TEP1 – для безметастатической выживаемости (p < 0.001 и p = 0.007 соответственно) и ADGRL3, PREX1 и CDKN2A – для общей выживаемости (p = 0.023, p = 0.023 и p < 0.001 соответственно). Обнаружено, что все мутации в гене CDKN2A были со сдвигом рамки считывания или приводили к появлению стоп-кодона, был найден патогенный вариант rs121913387. Для гена CUL7 вариант rs369167170 был повторяющимся для пациентов с рецидивами, а для гена PLEC вариант в регионе 7:18027430 C>A был повторяющимся для пациентов с метастазами. Анализ данных Атласа генома рака подтвердил связь только мутаций гена CDKN2A с прогрессированием ПКПР в возрасте до 45 лет (N = 18, p = 0.049), но не у пациентов старшего возраста (N = 109). Выявлены генетические нарушения, связанные с прогрессированием ПКПР в молодом возрасте, которые требуют подтверждения своей значимости на большей выборке больных и оценки функциональной значимости.

50 0