Статьи автора

Анализ идентичных районов гомозиготности в геноме кур яичного направления продуктивности и кур декоративных пород

Номер выпуска 4 от 01.04.2025

Искусственный и естественный отбор значительно увеличили фенотипическую и генетическую дифференциацию пород кур. Адаптация к условиям окружающей среды, включая акклиматизацию к суровому климату, оставила «следы» отбора в архитектуре генома многих пород. Поэтому мониторинг генетической изменчивости малочисленных пород кур является важной частью программ разведения и сохранения популяций домашней птицы. На основе результатов генотипирования пород кур с помощью чипа Illumina 60K Single Nucleotide Polymorphism (SNP) был проведен биоинформационный анализ кур яичного направления продуктивности и декоративных пород. Прогоны гомозиготности (ROH) были исследованы у яичных пород – чешской золотистой (ЧЗ), леггорн светло-коричневой (итальянская куропатчатая) (ИК) и декоративных пород – голландской белохохлой черной (ГБ) и гамбургской пятнистой карликовой (ГПК). Среднее число ROH в хромосомах кур варьировало от 200 ± 6 в ГБ до 287 ± 5 в ИК, а коэффициент инбридинга был от 0.29 ± 0.04 в ГБ до 0.50 ± 0.013 в ГПК. Среди изученных пород кур из 40 идентифицированных ROH-островков восемь идентичных островков были обнаружены у двух или трех пород кур. Эти ROH-островки были расположены на GGA1, GGA2, GGA7, GGA11 и GGA25. Гены в ROH-островках были ассоциированы с массой цыпленка, жировым обменом, потреблением корма, весом яичного желтка, расклевыванием перьев и молекулярными процессами, участвующими в репликации ДНК и процессинге мРНК. Феномен идентичных ROH-островков у разных пород обсуждается в контексте селекции.

38 0