By this author

Genetic Technologies and Methods of Combinatorial Chemistry and Biology in the Study of Biological Processes

Issue number 11 from 01.11.2025

Рассмотрены основные достижения в области прикладного использования алгоритмов больших языковых моделей (БЯМ) для решения современных прикладных задач структурной биоинформатики. В частности, рассмотрены конкретные успешные примеры применения БЯМ для предсказания потенциальных эпитопов на поверхности антигена, возможности конкретного CDRH3-фрагмента узнавать выбранный антиген и предсказания кросс-реактивности выбранных антител. Описаны частные случаи применения БЯМ для поиска и отбора связывающих антител против белка гемагглютинина вируса гриппа, предсказания эффекта точечных мутаций и повышения качества выравнивания белковых последовательностей. Также проанализированы основные недостатки современных алгоритмов БЯМ, связанные с интерпретацией весов модели, размером и структурой обучающей выборки и ресурсами, необходимыми для их обучения.

29 0