By this author

Antirestriction Proteins: Structures, Functions and Application Prospects

Issue number 9 from 11.03.2026

Системы рестрикции-модификации (RM) играют важную роль в защите прокариот от проникновения чужеродной ДНК. Гены белков антирестрикции, таких как ArdA и ArdB, зачастую являются первыми генами, входящими в клетку при заражении. Недавние исследования показали, что ДНК-мимикрирующие белки ArdA обладают специфичностью по отношению к RM-системам, а значит могут имитировать вполне определенные последовательности ДНК. Более того, такая специфичность может быть реализована с помощью недавно открытых очень маленьких ДНК-мимикрирующих белков sArdA. Это позволяет сделать выводы о перспективности применения таких ДНК-мимикрирующих "почти пептидов" для специфичного взаимодействия с ДНК-связывающими белками в целях точной регуляции внутриклеточных процессов. Другой класс антирестрикционных белков ArdB, напротив, по-видимому представляет собой универсальный ДНК-связывающий агент, стабильно ингибирующий рестрикционную активность всех известных RM-систем I-типа, а также CRISPR/Cas3, что может быть применено для повышения эффективности трансформации для трудно трансформируемых штаммов.

15 0

The Effect of Pharmacological Agents on the Expression of the Genes of the Chaperone GrpE and Co-Chaperone IbpA in Cells

Issue number 12 from 18.08.2025

Для изучения влияния фармакологических средств на экспрессию генов шаперона DnaK и ко-шаперона IbpA были использованы два биосенсора MG1655 pGrpE-lux и MG1655 pIbpA-lux. В качестве репортера экспрессии этих генов служит оперон бактерии , вставленный под промоторы генов и соответственно. Индукция экспрессии генов и указывает на способность тестируемых соединений влиять на фолдинг и рефолдинг белков. 10 из 12 тестированных соединений являются известными фармакологическими средствами. Фторхинолоновые ингибиторы топоизомераз – антибиотики ципрофлоксацин и налидиксовая кислота, цитостатики 5-фторурацил и митомицин C, а также антибактериальное средство диоксидин вызывали ответ у обоих биосенсоров, что указывает на способность этих веществ влиять на структуру как синтезированных белков, так и функционирующих в клетке белков. Рифампицин индуцировал ответ только у биосенсора pGrpE-lux, тогда как цисплатин и 5-бром-2-дезоксиуридин только у биосенсора pIbpA-lux. Цитостатик актиномицин Д проявил высокую токсичность для бактерий, что не позволило зарегистрировать его активность в отношении шаперонов. 6-Тиогуанин не вызывал ответа у обоих биосенсоров. Все эти соединения обладают мутагенной/генотоксической активностью. Стандартные генотоксиканты/мутагены 4-HXO и NaN индуцировали ответ у обоих биосенсоров. Обсуждаются возможности дальнейшего применения биосенсоров pGrpE-lux и pIbpA-lux для скрининга потенциальных ингибиторов шаперонов.

18 0